Ответсообщение недоступно
@vatolabs доброго времени суток.
Сегодня заморочился с червями, по сути разобрал их по запчастям.
- Завершил построение возрастной транскриптомной сигнатуры на основе single-cell RNA-seq C. elegans.
- Выделил основные клеточные популяции (нейроны, мышцы, кишечник, гермлайн и др.) и выбрал наиболее репрезентативные кластеры для дальнейшего анализа.
- Построил псевдобалк-образцы и выполнил дифференциальный анализ экспрессии между молодыми и старыми животными.
- Обработал RNA-seq датасет (5 независимых режимов обработки).
- Для каждого режима получил собственную DESeq2-сигнатуру препарата.
- Сравнил сигнатуры с возрастной сигнатурой и рассчитал количественный показатель Transcriptomic Reversal Index, характеризующий степень обращения возрастных изменений.
- Определил наиболее эффективный режим воздействия одного вещества чтоб попробовать отмотать в молодой кластер.
Если хотя бы что-то получится, то можно перебрать ещё некоторые вещества.