Доброго времени!
Для загрузчика так и должно быть.
Если хотите менять разрешение в загрузчике, либо, возможно, вообще отключать вывод на экран в процессе работы загрузчика, то можете сами что угодно сделать в нём, ссылки на исходники и информация по сборке доступны вот в этом разделе документации
https://repka-pi.ru/docs/130
Что касается применения разрешений из настроек уже после отработки PAM (тем более и после загрузки ядра, служб и display manager, PAM работает уже после этого) - с этим сейчас разбираемся.